Municipio situado en una zona mesetaria al sureste de la provincia de León Se encuentra en la vega del Esla, muy cerca de Valencia de Don Juan.

Originariamente era conocido como Villamagna, nombre que evolucionó hacia su actual versión, Villamañán, aunque también se cree que su nombre pueda venir del árabe, Villamannan, haciendo referencia a los numerosos manantiales de la zona.